武汉儿童医院成立于1954年12月，2003年9月与武汉市妇幼保健院合并成立武汉市妇女儿童医疗保健中心。2016年10月，挂牌华中科技大学同济医学院附属武汉儿童医院/第六临床学院。2018年10月，获批湖北省儿童医疗中心。

医院已形成“一院三区”的发展格局，编制床位2660张（主院区2000张，西院区660张），实际开放床位1539张，职工3000余人，其中医师892人，中高级职称占比61.43％，硕博士占比81.84％。医院最高门急诊量307万人次，出院病人10.3万人次，手术病人4.1万人次，分娩量10034人。

医院综合实力稳居全国儿科第一方阵，是中国儿科发展联盟首届常务理事单位，中华医学会儿科学分会和小儿外科学分会全国委员单位，小儿放射影像专业为全国组长单位，小儿神经内科、小儿病理及放射介入为全国副组长单位。小儿内科位列复旦全国医院排行榜第17位，儿童专科医院第10位，专科声誉榜华中地区儿童专科医院第2位，综合实力榜位居武汉市属医院第1位。2021年度中国医院科学量值（STEM），儿科学位列全国妇儿专科医院第12位，妇产科学位列全国妇儿专科医院第10位，变态反应学、传染病学、精神病学等5个学科全部进入全国百强。

医院专科设置齐全，技术力量雄厚，设有45个临床科室和15个医技科室，拥有国家级重点（建设）专科2个、省级重点专科21个，市级重点专科36个。拥有第四代达芬奇手术机器人、3.0T MRI、SPECT等一批先进的诊疗设备。医院拥有十大临床诊疗中心，是国家出生缺陷干预救助示范基地、全国罕见病诊疗协作网成员单位、全国日间手术联盟副主席单位、湖北省儿童白血病救治定点医疗机构。

2016年，医院牵头成立湖北省儿科医疗联盟，现已有联盟单位214家，构建了全省“1+17+N”儿科分级诊疗新格局，促进优质儿科资源下沉。医院作为湖北省儿科医疗质控中心组长和湖北省医院协会儿童医院（儿科）分会主委单位，通过开展儿科质量督查、巡讲，引领全省儿科高质量同质化发展。

医院坚持“科教兴院”办院方针，成立妇女儿童健康研究所，搭建全院科研平台，建立院士专家工作站。近年来，先后在新英格兰杂志、JAMA等国际顶级期刊发表高质量研究论文400余篇，最高影响因子达74分。医院现有博导2人，硕导60人，是华中科技大学同济医学院儿科学系副主任单位，2019年成为市属首家华中科技大学硕士研究生独立招生单位。医院是儿科、儿外科、妇产科、检验医学科、康复医学科和放射科等6个专业的国家级住院医师规范化培训基地，连续举办七届长江妇儿医学发展论坛，已成为国内知名的大型妇儿专科学术论坛之一。医院积极开展国际合作与交流，不断拓展对外交流合作领域，先后与德国、美国等国家的10余所大学和医疗机构建立长期合作关系。

医院坚持“慈善办院”理念，倡导成立“阳光宝宝”慈善救助公益基金，近6年，累计汇聚50余家慈善机构和单位，救助贫困大病患儿超6500人次。

近年来，医院连续12届蝉联湖北省“最佳文明单位”称号，2020年被授予市属医疗机构唯一一家“全国文明单位”。还先后被授予“湖北五一劳动奖状”“全国人文医院”“全国抗击新冠肺炎疫情先进集体”等荣誉称号。