广西壮族自治区妇幼保健院建立于1965年1月，历经50多年的发展，现已成为集保健、医疗、科研、教学和基层妇幼保健指导为一体的三级甲等妇幼保健院和爱婴医院，并形成广西妇幼保健院、广西妇产医院、广西儿童医院、广西出生缺陷预防控制研究所三院一所两院区的格局，设置有孕产保健部、儿童保健部、妇女保健部、门诊医技部及行政后勤部五大部门。医院编制床位1340张。全院在职员工2806名（截至2023年4月）。
医院历年来荣获多项荣誉，包括：全国医药卫生系统先进集体、全国卫生系统精神文明建设先进单位、全国三八红旗集体、全国“优秀爱婴医院”、中国优生优育先进集体等国家和自治区级荣誉两百多项。
医院被评为各级各类管理中心及技术培训基地，如国家级出生缺陷防治人才培训项目培训基地（广西唯一）、国家级儿童早期发展示范基地、全国自闭症儿童家庭关怀行动自闭症诊断干预培训示范基地、中国妇女盆底功能障碍防治项目技术培训中心、国家新生儿围产期医学专科培训基地、小儿麻醉培训基地和产科麻醉培训基地、标准化雾化中心规范管理项目示范单位、PAC优质服务医院、内分泌与妇科常见疾病培训基地、宫颈癌防控技术培训基地、出生缺陷干预救助示范基地、遗传咨询师培训授权机构，被纳入国家儿童疑难病症诊治能力提升工程建设项目储备库。获批广西超声诊断培训中心、广西产科质量控制中心、广西胎儿疾病临床医学研究中心，广西妇幼卫生信息管理中心、广西新生儿疾病筛查中心、广西产前诊断中心、广西地中海贫血产前诊断中心、广西地中海贫血产前诊断技术培训基地、广西新生儿听力筛查与儿童听力障碍诊治管理中心、孕妇学校师资培训广西基地。
医院已取得A级教学医院资质，成功入选国家新生儿围产期医学专科规范化培训试点基地，成功获批国家第三批住院医师规范化培训基地，首批开设妇产科、儿科和儿外科专业基地。与香港中文大学儿科学系、妇产科学系签订合作协议。
医院构建了涵盖全生命周期的妇幼健康服务链，涉及从心理到生理，从孕前、孕中、产时、新生儿至儿童包括妇女各阶段。医院开展多学科特色诊疗，进行跨专业多科协作，从日常保健、预防接种到常见病多发病、各类危重病症，基本实现妇幼诊疗范围全覆盖，让妇女儿童都能够得到高质量、全方位的健康服务。
医院拥有遗传疾病诊断、辅助生殖、危重孕产妇抢救和新生儿危重症救治等核心技术优质服务。医院危重孕产妇、新生儿抢救技术名列广西前茅，急救服务覆盖全区各市县。遗传代谢中心实验室是广西重大出生缺陷综合防治人才小高地。新生儿科是广西危重新生儿转运中心，危重病人抢救成功率达99％，急救服务网络覆盖全区各市县，辐射面积方圆300公里。
医院开创了多个“全国少数，广西唯一或第一”。在广西率先开展选择性减胎、宫内输血等胎儿宫内治疗技术；在广西率先开展腹腔镜子宫腹直肌悬吊术治疗子宫脱垂；是广西开展复杂性儿童先天性心脏病手术最多的医院之一，通过医疗技术结合救助资金的形式，让更多农村地区的孩子重获新生；拥有广西规模最大、设备最齐全、服务范围最广的新生儿医疗中心、成功救治广西目前最低出生体重的早产儿，体重仅500克。在广西率先获得无创产前筛查项目资质；自主研发应用于遗传病诊断的基因芯片、高通量测序基因捕获试剂盒，诊断包括地中海贫血等在内的110种单基因疾病，245种染色体疾病；在国内率先开展全外显子测序、无创低深度全基因组测序应用于产前诊断。成立广西首家出生缺陷生物样本库，储存150多万份各种类型样本，为科学研究和辅助决策服务。是国内率先开展“选择性囊胚培养-单囊胚移植技术”的医院之一，是广西首家掌握显微取精手术、实施精子优选、微量精子冷冻等技术的医院。是南宁市首家可行胚胎植入前遗传学检测的单位。
医院加强学科专科建设，产科荣获国家级临床重点专科建设单位，三大专科获批第一批国家妇幼保健特色专科建设单位（国家孕产期保健特色专科建设单位、国家更年期保健特色专科建设单位、国家新生儿保健特色专科建设单位）；儿科、重症医学科、产科、妇科、医学影像科、医学检验科6大学科成为广西临床重点专科；医学遗传学科、新生儿科、超声医学科、产科、儿童保健科、妇科、生殖医学科、妇儿麻醉医学科、儿科学9个学科成为广西妇幼健康服务重点学科；儿科学、麻醉医学2个学科成为广西医疗卫生重点学科；生殖健康与出生缺陷防治实验室获批自治区重点实验室；广西出生缺陷及干细胞生物样本库重点实验室、广西遗传性疾病精准诊治重点实验室和广西出生缺陷防治基础研究重点实验室3个实验室成为获批第一批广西卫生健康委重点实验室。医院获批成为广西胎儿疾病临床医学研究中心、广西儿科疾病临床医学研究中心。
医院儿科、妇产科系列亚专科建设特色鲜明，拥有儿科系列的新生儿科、儿童呼吸内科、儿童神经内科、儿童心脏外科、儿童重症医学、儿童内分泌科、儿童消化内科、儿童康复科、儿童骨外科、儿童群体保健科、儿童生长发育科、儿童口腔保健科、儿童耳鼻喉保健科，产科系列的母体医学、胎儿医学、MICU、婚前保健科、孕前保健科、孕期营养科、孕期心理科，拥有妇科系列的生殖健康科、生殖中心、计划生育科、妇女群体保健科、乳腺保健科、妇科肿瘤与介入科、妇科内分泌科、盆底康复科、更年期保健专科等。
医院重视科研发展，近五年来，共承担各类科研项目365项，其中国家自然科学基金项目14项，国家重点研发计划课题1项，省部级科技计划项目14项，荣获各类科技成果奖项31项，其中全国妇幼健康科学技术奖二等奖1项、三等奖3项，中国出生缺陷干预救助基金会科技成果奖三等奖1项，广西科技进步奖二等奖2项，广西医药卫生适宜技术推广奖一等奖5项。主编出版图书6本，参编参译著作28本。发表学术论文1466篇。
医院切实贯彻执行“一法两纲”和妇幼卫生工作方针，认真履行职责，努力完成妇幼卫生各项工作任务，全区妇幼卫生指标达到“两纲”目标要求。年均承担全区各类妇幼保健项目培训约50次，受训人员约1.2万人。
广西儿童医疗中心于2020年正式开工建设，目前正在建设中。项目规划设置800张病床，总建筑面积约11万平方米，通过地上连廊与广西妇幼保健院厢竹院区连接，实现两院区资源共享及一体化管理。广西儿童医疗中心将建设成为高水平、智慧型的儿童医院。
我们始终坚持妇幼卫生工作方针和妇幼保健院办院宗旨，以“仁、德、精、新”的院训精神为医院核心价值观，以人为本，至善尽美为服务理念，以保健为中心，以保障生殖健康为目的，以科学技术为支撑，保健与临床相结合，面向基层，面向群体，以提高出生人口素质，守护妇女儿童健康为己任，医院正积极适应发展新常态，紧抓发展机遇，从建筑装备硬件设施、技术人才软件环境、高精尖核心技术研发等方面打造区域及东盟地区领先的省级现代化妇女儿童医疗保健中心。