黔东南州人民医院始建于1950年，前身为镇远专署人民政府卫生院，1956年7月，黔东南苗族侗族自治州建州，医院正式更名为黔东南苗族侗族自治州人民医院（简称黔东南州人民医院），是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复等功能为一体的国家三级甲等综合医院。医院始终秉承“自强、博爱、求真、创新”的院训，努力打造成为医、教、研、管协同发展的高水平现代化管理智慧医院。下属医疗机构有黔东南州公共卫生应急中心（传染病医院）、黔东南州儿童医院、黔东南州妇幼保健院、黔东南州肿瘤医院。是全国住院医师规范化培训基地和全科医师转岗培训基地、国家紧急救援中心网络医院，是贵州省高等医学院校临床教学基地和湖南医药学院教学基地。
目前医院医疗用房面积达16万平米。公立医院改革核定编制床位为1600张，实际开放床位2000张，医院拥有临床医技59个专业，是贵州省黔东南州产前诊断分中心、黔东南州危重孕产妇救治中心、黔东南州危重新生儿救治中心、国家高级卒中中心、国家胸痛中心（标准版）、中国创伤救治中心、国家级深静脉血栓性疾病救治中心、中国心衰中心、中国房颤救治中心、中国癫痫治疗中心等多学科合作治疗中心；有神经外科、重症医学科、肿瘤科、呼吸内科、骨科、肛肠外科、泌尿外科、肾内科、消化内科、心血管内科十个省级建设重点专科，重症医学科1个省级重点学科；有15个专业规培基地等。2022年门急诊量81.99万余人次，年住院收治病人7.11万余人次，年手术3.5万余台。
医院积极推进高质量建设，坚持“以疾病为中心”向“以健康为中心”化转变，以学科、人才队伍和信息化建设为支撑，以医疗质量、医疗服务、医学教育、临床科研，医院管理提升为重点。积极推动省级区域医疗中心建设工作，建强建好人才队伍，大力强化学科建设，推动教学科研协同发展，倾力打造智慧医院，打造5G医疗，进一步提高医疗服务效率，深化平安医院建设。依托省级区域医疗中心与贵州医科大学附属医院开展合作，培育一批具有专业水平的优势专科。每年医院投入大量资金引进高精尖诊疗设备，促进新项目、新技术的开展。支持优势学科发展，促进学科升级和优质学科资源整合。
目前，全院在岗职工2382人，正高职称84人，副高职称180人，博士生4人，硕士研究生137人，设有1个博士工作站。全国劳动模范2人，享受国务院特殊津贴1人，省政府特殊津贴2人，贵州省千层次创新型人才3人，州管专家15人。
近年来，医院先后获全国文明单位、全国卫生系统先进集体、贵州省“五好”基层党组织，贵州省“五一”劳动奖状、全省精神文明建设工作先进单位、全省脱贫攻坚先进党组织、抗击新冠肺炎疫情“贵州省三八红旗集体”等荣誉称号。荣获贵州省总工会“五一巾帼标兵岗”、贵州省妇女联合会、贵州省人力资源和社会保障厅“2022年度贵州省巾帼文明岗”、黔东南州“工人先锋号”，其中14名医务人员荣获第二届贵州省“最美劳动者”称号，50名援沪医疗队员获黔东南州委州政府通报表扬，179名援筑援毕人员获得通报表扬，医务人员相继获得国家、省、州先进个人奖项达300余项次。
医院始终坚持党委领导下的院长负责制，坚持党建引领、文化建院，将党建工作与医疗业务、组团式帮扶、精准扶贫、医德医风等工作深度融合，积极承担公立医院社会责任，以公立医院改革和服务群众为中心，努力抓重点、补短板、补弱项、强优势，以人民健康为中心，提高医院服务水平，增强医院综合实力，有效落实医院精细化管理工作流程，建立健全现代化医院管理工作，形成管理科学、治理完善、运行高效的现代化医院。