齐齐哈尔市中医医院始建于1952年，是三级甲等中医医院，也是黑龙江省西部地区集中医、中西医结合医疗、保健康复、科研教学、技术指导、服务为一体，具有鲜明中医特色和三级甲等技术资质以及全国百姓放心的、现代化大型综合性中医医院。医院先后与多家全国著名医院，以及全市众多县乡级医院建立医疗协作关系，并成为全省唯一一家中医区域诊疗中心及齐齐哈尔市中医医疗集团的核心单位。2021年被确定为“国家中医急诊与重症医学区域诊疗中心协作单位”“国家中医紧急救援基地联盟副主席单位”“国家中医紧急救援基地联盟成员单位”。
医院以党建工作为引领，坚持“保质量、强服务、持续开展专科专病建设、打造名医名院品牌”的指导思想，积极发挥党委把方向、管大局、作决策、促改革、保落实的领导作用，扎实推进党组织和党的工作全覆盖，推动党建与业务工作双融合、双促进，特色学科体系日益完善，走出了一条“突出中医中药特色，发挥专科专病特长，体现科技时代特点”的健康发展之路。2021年，医院把“学党史、悟思想、办实事、开新局”作为首要政治任务和创新破局的实践载体，高站位谋划、高起点布局、高标准推进，创新提出“四化、三减、两提升”的目标思路，从中国共产党百年奋进史中汲取精神动力、发展智慧、创新勇毅、经典自信，使全院上下党史学习教育取得扎实成效。
医院实施集团化发展，拥有南院、北院和龙华社区卫生服务中心，托管了昂昂溪区医院和卜奎中医院。医院设有开放床位近2200张，近百个临床医疗、医技科室。拥有日本东芝640层动态容积CT、美国GE64排螺旋CT、东芝DSA、美国GE3.0T和飞利浦3.0T磁共振成像系统、腹腔镜、关节镜、椎间镜、美国贝克曼大生化系统、手术显微镜等一大批高精尖诊疗设备。
南院于2011年破土动工，总建筑面积近19万平方米。环境宽敞明亮、设备精良，科室齐全、医疗技术力量雄厚。2013年6月26日，建筑面积6.16万平方米的南院一期门急诊病房综合楼宏业骏开；2016年6月26日，凸显现代气派，总建筑面积7.44万平方米的南院二期工程百草养生院全面竣工投入使用。这个集“医、养、居、娱、食、为”于一体的新型养老机构，连续多年在“中国医院竞争力医养结合机构50强”中位列前三；2018年6月26日，功能完善、设施先进、建筑面积达5.24万平方米的南院三期病房综合楼全面竣工，标志着医院南院大规模建设工作基本完成。
北院地处我市繁华地段，建筑面积3.17万平方米，地理位置优越、就医方便，中医特色浓厚，多位名老中医常年坐诊。2019年完成病房装修改造，2020年对科室进行了重新整合，在历任院领导的带领下，精医道、求卓越、施仁爱、重诚信，为规模化发展打下了坚实基础。
医院按照“突出中医中药特色、发挥专科专病特长、体现科技时代特点”的“三特”办院方针，倾全力加强人才培养，梯队建设已成规模，拥有多名省级名中医、省青年名中医、龙江名医、鹤城名中医；博士生、硕士生共200余名，省、市级专业委员会主任委员、副主任委员及学科带头人80余人的雄厚实力的专业队伍。医院倾全力加强人才培养，截止2021年共有33人被国家、省中医药管理局中医临床特色技术传承人培养项目、中医护理骨干人才培养项目、中药特色技术传承人培养项目确定为培养对象；启动首批院内中医临床优秀人才培养项目，确定培养对象10人。
医院中西合璧，专科特色突出。儿科、肛肠科、急诊科、肾病科、治未病中心是国家级重点专科；拥有骨伤科等12个省级重点专科，中医儿科等29个市级重点专科，14个市级重点专病。医院细化专科管理，成立了肛肠、儿科、骨伤三个分院，构建了心衰中心、胸痛中心、卒中中心、房颤中心及肺小结节筛查中心五个专业中心机构。
医院的中药全部采用道地药材、独具特色，拥有已取得了省级GMP认证、建筑面积2811平方米的现代化中药制剂室一座，可生产丸剂、散剂、胶囊剂、颗粒剂、软膏剂等多个剂型，自制中药制剂63种，且全部应用于临床，疗效颇佳，已成品牌。医院开展的“卜奎膏方”推广应用工作成效显著，于2019年5月新建了中药煎药中心和膏方制作中心，占地面积共400平方米，在运用国内领先的现代化煎药和膏方制作设备的同时，沿袭古法工艺，应用传统铜锅，用竹板进行收膏，最大限度地满足患者的用药需求。
医院积极开展科研工作，成果丰硕。医院成立龙江医派研究会卜奎工作委员会，大力开展中医技术传承工作；力邀国内知名专家，先后成立了14个名医工作室，名医工作室专家们以良医妙药为媒，依托现代医学技术赋予的先进诊疗手段，兼容并蓄，让中医文化开枝散叶，造福鹤城百姓。
医院建立了设施完备、标准规范的中医住院医师规范化培训基地。2017年12月29日，医院顺利通过国家级住培基地认定评审，正式成为国家级中医住院医师规范化培训基地。基地教学力量雄厚，现有师资209人，硕士以上学历占比37.17％，副高级以上职称占比69.63％。
医院的护理工作屡有创新并成绩卓著。积极开展优质护理服务，服务举措多种多样，尤其是在中医护理方案的执行中耳穴埋豆、中药湿敷、中药熏洗等57项中医特色护理项目，深受患者欢迎。曾为省中医药管理局确定的全省中医系统“优质护理服务示范工程”试点医院，并两次荣获“全国中医护理先进集体”称号，在各类国家、省、市护理技能竞赛中成绩优秀。现为粤港澳地区中医护理联盟等四项成员单位及黑龙江省护理专科联盟区域分中心。
医院以突出中医药特色优势为主线，以公立医院改革为重点，不仅坚持中医为本的宗旨，发挥中医药简、便、廉、验的传统优势，提高服务百姓的能力和水平，更是依托现代医学技术赋予的先进诊疗手段，兼容并蓄，着力提升综合救治功能，加强学科内涵建设，持续改进医疗服务质量，不断提高群众就医体验。
医院中医药文化特色鲜明。凝练出“精医道、求卓越、施仁爱、重诚信”的院训和“扬岐黄精魂、兴百草大志”的医院精神，拥有自己的院徽、医院名称固有文字标识和院歌等。医院创办了风格突出、内容丰富的《齐齐哈尔市中医医院报》，编印了《院志》《中医药文化手册》《名医风采录》《行为规范手册》《中医药文化核心价值观念读本》《膏方手册》《中医养生保健手册》《中医康复之家》《中俄文中医药特色手册》等，并制作多部展示中医人无私奉献精神的专题片、中医知识科普宣传片，以及利用微信公众号、视频号、网站等平台，积极弘扬中医药文化。
通过不懈努力，医院两次顺利通过国家三级中医医院等级复审，并曾荣获全国卫生系统先进单位、全国五一劳动奖状、全国中医药文化建设先进单位、全国模范职工之家、全国厂务公开民主管理先进单位、全国“孝亲敬老”先进单位、全国中医护理先进集体、全国卫生系统百强单位、省劳模大会模范单位、省行风建设先进单位、省医德医风示范医院、省优质护理服务先进单位、省抗击新冠肺炎疫情先进集体、全市战疫堡垒、新时代最美鹤城群体等诸多荣誉，并连续三次荣获“全国百姓放心示范医院”和“省级文明单位标兵”称号。2018年，医院进入全国中医医院综合实力排行百强单位。