重庆市人民医院（重庆市医学科学院、重庆市眼耳鼻咽喉科医院）是重庆市首批三级甲等综合性医院。经重庆市政府批准，由原重庆市第三人民医院、重庆市中山医院合并组建，于2016年3月25日挂牌成立。医院现有院本部（星光大道118号）、渝中分院（原市三院和市中山医院），是重庆市设置的五所综合性医院之一。
医院现有临床医技科室53个。有国家临床重点专科（过敏反应科）、国家临床重点专科能力建设项目（医学检验科）、国家神经系统疾病临床医学研究中心重庆分中心、重庆市临床检验中心，以及重庆市骨伤骨病医疗中心、重庆市甲状腺结节与甲状腺癌专病临床诊疗中心，重庆市肺结节与早期肺癌专病区域临床诊疗中心，重庆市脑胶质瘤精准医学研究中心。拥有重庆市医学重点学科6个（心血管外科学、骨科学、老年病学、耳鼻咽喉学、医学检验学、呼吸病学），重庆市临床重点专科16个（重症医学科、医学检验科、麻醉科、呼吸与危重症医学科、骨科、老年病科、医学影像科、神经外科、消化内科、神经内科、心血管内科、普通外科、心胸外科、肿瘤科、耳鼻咽喉科、妇产科），市级医疗特色专科1个（康复医学科），市级首批公共卫生重点专科（学科）建设项目1个（眼科近视防治），市级临床医学研究中心4个（心血管外科学、检验医学、耳鼻咽喉疾病、老年疾病），市级重点实验室2个（神经变性病重庆市重点实验室、肝胆胰疾病智慧诊疗工程重庆市重点实验室），市级研究所3个（重庆市心肺血管疾病医疗研究所、重庆市老年病防治研究所、重庆市老年慢性疾病研究所），市级研究室2个（重庆市肾脏病透析治疗研究室、重庆市临床检验质量控制研究室）。
医院现有编制床位2000张，职工2540人，其中专业技术人员2245人，高级职称420人，博士110人，拥有一批双聘院士、长江学者特聘教授、中华医学会现任主任委员、教育部“长江学者创新团队与发展计划”带头人、国务院政府特殊津贴专家及重庆市突出贡献专家、市级学术技术带头人、重庆英才；是国家级博士后科研工作站、国家住院医师规范化培训基地（17个专业）、国家临床药师规范化培训基地、国家药物及医疗器械临床试验机构、重庆市护士规范化培训基地、重庆市专科护士培训基地（耳鼻咽喉、健康管理）。拥有一批博士生导师和硕士生导师，在读博士生46名，硕士生142名。
医院历史悠久，文化底蕴深厚。院内有原苏联驻华大使馆、国民政府立法院、司法院及蒙藏委员会旧址、抗战军事防御工程石碉堡等历史文化地标性建筑。
重庆市人民医院三院院区前身是1929年创立的国民政府中央医院，1939年迁至重庆。1945年在学田湾设立国民政府中央医院城区门诊部，1947年该门诊部迁至现址（渝中区枇杷山正街104号），更名为国民政府中央医院重庆城区分院，1950年后相继整编为西南军政委员会、西南行政委员会直属医院。1951年负责西南局机关干部医疗保健工作，1954年设置全市唯一一家地专级以上高级干部病房（直至20世纪80年代），1955年正式命名为重庆市第三人民医院。1985年成为重庆市唯一的副厅级医院，1991年增挂重庆市老年病防治研究所，1993年成为全市首批三级甲等医院，1997年增挂重庆市临床检验中心，2003年增挂重庆市眼耳鼻咽喉科医院，2006年增挂重庆中俄友好医院。
重庆市人民医院中山院区前身是1935年创立的重庆义林医院，位于重庆市渝中区中山一路。1950年命名为重庆市第二人民医院。1961年按中央卫生工作会议决定进行学科调整，组建成全国唯一的外科医院即重庆市外科医院，同期建成中国第一个肝胆外科临床科室。1995年增挂重庆市心肺血管疾病医疗研究中心，1996年增挂重庆市骨伤骨病医疗研究中心，2001年更名为重庆市中山医院。2012年与重庆市肺科医院合并组建重庆市中山医院。
重庆市人民医院江北院区前身是重庆市肺科医院，创建于1956年，以呼吸疾病尤其是结核病防治为主，是西南地区较大的治疗各种肺部疾病和重庆市指定治疗结核病专科医院。医院曾用名为重庆市江北干部疗养院，后更名为重庆市第二结核病医院，1984年被市政府正式定名为重庆市肺科医院。1996年经市政府批准，增挂重庆市第十二人民医院。2012年与原重庆市中山医院正式合并成立重庆市中山医院。2019年12月27日，江北院区停诊。