云南中医药大学第二附属医院，始建于1970年9月，原为“云南省交通中心医院”，2018年6月划转至云南省卫生健康委和云南中医药大学，更名为“云南中医药大学第二附属医院”。2020 年 7 月，实施了与学校针灸推拿康复学院“院院合一”的改革，形成云南中医药大学第二附属医院、云南省血栓病医院、第二临床医学院和针灸推拿康复学院“四块牌子一套班子”的管理体制和运行机制。
经过50多年的建设，医院已发展成为一所以血栓病防治、针灸推拿、康复治疗为特色的集临床、教学、科研为一体的大学附属医院。共有土地面积74.22亩，其中东部菊花村院区5.82亩，西部黑林铺院区68.4亩。现有编制床位455张，在职职工504人，正高17人，副高75人，博士18人，硕士87人，博士生导师2人，硕士生导师 16人。享受云南省特殊津贴专家4人，云南省名中医 1人，第七批国家级名老中医师带徒指导老师1人，第五批省级名老中医药专家师带徒指导老师1人，“兴滇英才支持计划”名医1人，“兴滇英才支持计划”青年人才2人，云南省中青年学术和技术带头人后备人才1人，云南省卫健委高层次中医药后备人才1人。设有20个职能科室、24个临床医技医辅科室，8个教研室和1个针灸推拿康复研究所。
建有120东区急救站，加入全市急诊医疗网，承担突发公共卫生事件和灾害事故的紧急救援任务，成功申报国家级“高血压达标中心”、国家级“防治卒中中心”，是云南省中医（脑病）、云南省中医（康复）区域诊疗中心，云南省中医（康复）示范基地，针灸科、推拿科、内分泌科和妇科为云南省省级中医特色专科建设单位。
现有飞利浦DSA、西门子核磁共振、东芝80排螺旋CT、东芝彩超、奥林巴斯电子腹腔镜、电子胃肠镜、ＧＥ公司ＤＲ、上下肢康复机器人等先进医疗设备。
目前承办针灸推拿学、康复治疗学、中医康复学和中医养生学四个专业，共有本科、硕士和博士研究生2664名。借助云南省高校针灸推拿防治脑病重点实验室、云南省高校针灸防治神志病创新团队、云南省科技厅朱勉生专家工作站和梁繁荣专家工作站等科研平台，近5年新增国家自然科学基金项目9项，省部级课题20余项，形成了医教研协同，本、硕、博联动的人才培养体系。
我们将继续发扬“护佑生命、救死扶伤、甘于奉献、大爱无疆”的职业精神，秉承“崇德精医、传承创新”的院训，牢记“为党育人、为国育才”的使命，以临床为基础、教学为中心、科研为动力、康养服务为特色，为云南大健康产业作出新的更大的贡献！