始建于1991年的甘泉医院承载着同济大学重振同济医科的责任与使命，在2000年，新世纪伊始汇入同济大学，更名为同济大学附属同济医院。“同济医院”这个名字再一次矗立在上海这片土地上，开始了崭新的征程。2010年同济医院划归上海市人民政府，隶属于上海申康医院发展中心，由同济大学与上海申康医院发展中心共同管理。如今，承载了同济百年医学梦想的同济大学附属同济医院在历史的见证下，同济之魂一次次觉醒，在同济大学与上海申康医院发展中心的领导下，同舟共济、奋力拼搏，攀登上了一座座医学的高峰。
同济大学附属同济医院作为普陀区唯一的三级甲等综合性医院，核定床位1100张，开放床位1300余张，年门急诊量超过200万人次，出院病人7万余人次，手术4万余台次。血液内科建立的难治复发血液系统恶性肿瘤治疗体系入选国家临床重点学科建设项目。医院拥有高级卒中中心、胸痛中心及创伤救治中心三个国家级中心。拥有国家临床重点专科血液内科、上海市重中之重临床重点学科骨外科学、精神神经学科，上海市重点学科心血管内科；上海市临床重点专科精神医学科、脊柱外科、消化内科；急诊与危重症学科、老年医学科、心身医学、药剂科入选上海市重要薄弱学科建设计划；检验医学科入选上海市公共卫生三年行动计划，临床药学入选上海市临床药学重点专科建设项目。院内形成以骨科、心血管内科、精神神经学科为重中之重重点学科，以消化内科、医学影像科、血液内科、内分泌代谢科、普通外科为重点学科，以妇产科、呼吸与危重症医学科、肾脏内科、泌尿外科、老年医学科、检验科、神经外科、皮肤与性病科、病理科、胸心外科为特色学科的整体学科建设框架。医院整合学科优势，基于多学科合作，成为沪西北地区的大型急诊危重症与疑难杂症综合诊治中心。在老年心血管病介入治疗、严重创伤与急危重症救治、干细胞再生修复脊髓损伤、运动障碍诊治与康复、肿瘤免疫细胞治疗、女性盆底功能障碍微创重建、严重神经精神疾病、消化道肿瘤综合微创诊疗等方面的临床和基础研究居于国际国内先进水平。
同济医院秉持“强临床、升研究、重服务”的理念，依托同济大学深厚底蕴，建有国家级“国际科技合作基地——干细胞与再生医学国际联合研究中心”“脊柱脊髓损伤再生修复教育部重点实验室”。拥有国家级“有突出贡献的中青年专家”、国家级“百千万人才工程”、科技部万人计划、国家自然科学基金国家杰出青年、国家自然科学基金优秀青年、国家自然科学基金优青（海外）、上海市“领军人才”、上海市“优秀学术带头人”等为代表的高水平专家队伍。近年来承担“国家重点研发计划”“科技重大专项”“973计划”“863计划”“科技支撑计划”和“国际科技合作项目”“自然科学基金重大、重点项目”等国家级重点项目30余项。成果发表在《SCIENCE》《NATURE》《CELL》等高质量学术期刊。荣获“国家自然科学二等奖”“教育部自然科学一等奖”“教育部科技进步一等奖”和“上海市科技进步一等奖”等为标志的高等级科研成果。
同济医院作为同济大学直属附属医院，重视医学人才的培养。拥有临床一级学科硕、博士学位点，设有临床医学博士后流动站，承担着本科生、研究生、留学生及规范化住院医师、专科医师等教育培训任务。拥有国内首家3DHD手术转播系统/远程医疗示教基地，是中华医学会视听教材制作基地及世界卫生组织上海卫生科普健康教育基地、国家临床教学培训示范中心。拥有一批国家级、省部级、校级优秀师资，获批上海高校市级重点课程、上海高等学校一流本科课程、上海市全英文示范课程等。培养的医学生获得中国青少年科技创新奖、“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛二、三等奖、上海市市赛金奖、首届全国全科医师临床技能大赛第二名、医学生临床技能竞赛全国三等奖、华东赛区特等奖、首届上海市医学生技能竞赛一等奖、上海市年度人物、上海市市长奖、宝钢特殊奖、上海市青年五四奖章等荣誉称号。
作为一所拥有百年历史品牌的现代化医院，同济医院执着于精湛的医术，连续24年蝉联“上海市文明单位”称号，并荣获首批“全国党建工作样板支部”“全国巾帼文明岗”“全国青年文明号”等荣誉。医院坚持公益性的办院方向，秉承“同舟济世，博医精诚”院训，形成了具有同济特色的“一源三脉”文化体系，扎根于“医源文化”修于内而溢于外，立足于“家文化”的温馨和凝聚，开枝于“健康传播文化”与“健康服务文化”的延伸。以济人济世之心传医者之道，在历次重大抢险救灾、国际援助、抗击疫情、扶贫帮困中发挥了同济人“同心同德同舟楫”的博大胸怀，将同济天下的爱国情怀洒满大地。