中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院（以下简称“所院”）坐落于北京市东城区东单三条5号，成立于1978年，其前身为1921年建立的北京协和医学院基础医学系和1958年成立的中国医学科学院实验医学研究所。所院以学科建设为基础，重视科研发展与人才培养，共设置13个学系，拥有对国内外开放共享的医学分子生物学国家重点实验室、国家生物医学实验细胞资源库、国家发育和功能脑组织资源库、国家人口与健康科学数据共享平台基础医学数据中心、国家级基础医学实验教学示范中心5个国家级教学科研平台中心，承担着中国医学科学院-北京协和医学院医学科研和医学教学两大任务。
所院人才济济，在职职工341人，其中两院院士6人，国家级人才项目获得者18人，省部级人才项目或人才资助获得者30余人次，课题组长56人，高级职称专业技术人员132人。依托院校准长聘政策、高层次科技人才队伍建设行动计划引进高端人才，现有准长聘教职30人，其中长聘教授14人、准聘副教授7人、助理教授9人。与此同时，借助“协和青年学者支持计划”和“协和海外青年学者支持计划”吸引和造就拔尖青年后备人才。

所院承担着北京协和医学院八年制医学专业本科生、“4+4”临床医学生、护理学本科和硕士、博士研究生的教学任务，是国家首批博士学位和硕士学位授予单位。所院牵头的基础医学学科在第五轮学科评估中获得A+，牵头的生物学学科（基础医学支撑）、参与的药学、生物医学工程、公共卫生与预防医学学科均入选新一轮“双一流〞建设名单。生物学（生化及分子生物学、细胞生物学、遗传学、生物物理学、生理学）为国家一级重点学科；药理学、免疫学和病理-病理生理学为国家二级重点学科。现有博士生导师63人，硕士生导师35人，在读研究生517人，并设有基础医学博士后流动站。2012年，北京协和医学院获得财政部“小规模特色办学”经费支持，教学实体化迈出重要一步，教育教学改革工作取得明显成效。生理学和药理学教研室入选教育部虚拟教研室建设项目，多门课程入选教育部课程思政示范课、北京高校优质本科课程、校级一流本科课程等；多个教学团队荣获课程思政教学团队、北京市优秀本科育人团队等荣誉称号，多名教师获得全国及北京市教学教务比赛奖项。

所院国绕国家卫生与健康领域重大需求，坚持“四个面向”和科技创新的顶层目标，结合《健康中国2030》发展规划、医学与健康科技创新工程的实施，重点强调功能基因组、表观遗传、蛋白质组、代谢组、纳米医学、特殊环境医学等与疾病相关领域的基础研究。同时致力于从基础到临床的转化研究，从分子、细胞、组织、器官、个体等不同层面认知健康与疾病的特征，采用系统生物学的思维方式，探索肿瘤、心血管疾病、神经精神系统疾病、感染性疾病、免疫系统疾病、罕见病等重大疾病病因、诊断、治疗、预防机制，为制定适合我国国情的重大疾病早期预警、干预策略以及防治方案提供科学依据。

所院承担国家重点研发计划、科技创新2030、国家重大科技专项、科技基础资源调查专项、国家自然科学基金（基础科学中心项目、重大项目、重点项目、杰出青年基金项目、优秀青年科学基金项目、海外优青基金项目）、国际合作项目、北京市科技计划、教育部/外国专家局创新引智计划等国家级科研项目。近年来，发表论文数目稳定，质量稳步提升，多篇文章发表于国际著名期刊Science、Cell、Circulation、Nature Cell Biology、Nature Immunology、Nature Metabolism、Nature Medicine、Nature Communications、Science Immunology、Science Advances、Cell Host and Microbe、Cancer Cell等杂志。2000年以来，获得国家级和省部级科技奖励34项，其中国家自然科学奖二等奖3项、国家技术发明奖二等奖1项、国家科技进步奖二等奖1项。

所院积极推动基因、单克隆抗体诊断试剂、基因工程药物、中西药物、疫苗以及高分子材料等科技成果的推广与转化工作，与国内外二十余家企业建立了良好的合作关系。2000年以来，申请发明专利486项，授权221项（含国外专利20项）。

所院学术文化氛围浓厚。2022年，成功承办以“筑根基、促创新、济民生”为主题的首届中国医学基础学科发展大会；多年来定期举办“协和博新论坛”、协和生物医学论坛、PI Club等学术活动；与北京协和医院合作承办《基础医学与临床》杂志。

所院拥有先进的实验技术支撑条件和良好的学术环境。经过十余年的努力，2019年根据科技部、财政部发布的国家科技资源共享服务平台优化调整名单，以我所为依托单位的“国家生物医学实验细胞库”“国家发育和人脑组织资源库”均列入30个国家生物物质和实验材料资源库中，并通过卫生健康委组织的资源库建设实施方案论证。此外，所院还拥有仪器中心、实验动物中心、组织病理中心与生物信息中心，对内对外实现开放共享服务。此外，13个院校内设研究中心（中国医学科学院蛋白质组学研究中心、组织工程研究中心、纳米生物医学联合研究中心、遗传医学中心、生命伦理学研究中心、神经科学中心、系统医学研究中心、医学灵长类动物研究中心、免疫治疗研究中心、环境与健康研究中心、儿童发育与疾病研究中心、表观遗传研究中心、生物医学大数据研究中心），2个院校重点实验室（RNA调控与造血发生研究重点实验室、T细胞与肿瘤免疫治疗重点实验室），以及中国疾病负担研究推广中心（CMB资助）也挂靠在所院。

所院具备良好的合作基础，在国内外享有较高的声誉和地位。许多专家在国际医学科学院组织、全球慢性疾病联盟、国际生物医学工程学会、中华医学会、中国遗传学会、中国免疫学会、中国生物医学工程学会、中国解剖学会、中国生物化学与分子生物学会、中国生物物理学会、中国生理学会等国内外学术机构担任重要职务。中国免疫学会、中国生物医学工程学会、中国解剖学会、中国生化及分子生物学学会医学生化专业委员会、北京生理科学会、中华医学会医学遗传学会、北京生物化学与分子生物学会等学术机构挂靠在所院。

今日之基础所院将紧密围绕基础医学服务于国家人口大健康方略，借助“十四五〞科技体系优化布局和空间提升的良好契机，遵循“增强定力、激发动力、汇聚合力、精准发力〞的工作方针，以建成我国医学科技创新体系的核心基地、“前沿阵地”和国际一流医学教育创新的“主引擎〞为发展目标，充分依靠学术委员会、教育工作委员会，发挥全所院专家的集体智慧，科学管理、民主决策，巩固开拓优势学科领域。同时致力于构建高效的管理体系和规范的工作程序，努力提高管理效率和水平，为实现所院发展目标提供保障，努力建设成为立足全球医学科技前沿、堪当国家使命重任的卫生健康科技战略力量。