北京市平谷区中医医院始建于1986年，1996年被评为二级甲等中医医院，2015年晋升为“三级甲等中医医院”，2023年5月顺利通过三甲复审。医院占地面积40885.11平方米，建筑面积46051.36平方米。
床位编制800张，实际开放床位419张。
现有科室55个，其中职能科室21个，临床科室27个，医技及辅助科室7个。
由医院发工资的共1050人。与医院有直接劳务关系职工880人，（其中在编职工441人，非在编职工439人）。由第三方派遣员工170人。
卫技人员707人。其中医师260人，护士342人，医技60人，药师45人。中医类别执业医师176人，占执业医师比例为67.7％。高级职称100人，中级职称383人，初级职称295人，硕博士研究生119人。
医院现有享受政府津贴专家2名，首都国医名师1名，首都名中医1名，首都中青年名中医1名，国家级传承指导老师1名、市级传承指导老师4名，北京市中医卓越人才、复合中医药学术带头人1名，全国优秀中医临床人才1名。国家级名老中医传承工作室1个，北京中医药薪火传承3+3工作室2个，北京中医药薪火传承3+3工作室分站4个。
医院有市级以上重点专科6个，其中国家中医药管理局重点专科培育项目1个，为康复科，市级重点专科5个，分别为十一五期间重点专科骨伤科，十二五重点专科康复科、内分泌科、脑病科，十四五重点专科推拿科、针灸科，专科建设在不断完善与发展，并不断夯实中医特色优势和基础。
三年来，医院承担北京市自然科学基金（青年项目）1项，北京市首都卫生发展专项课题3项；北京中医药科技发展资金项目2项；区卫健委科研项目5项，院级科研项目20项；与市三甲医院合作项目9项。累计发表省级以上核心期刊论文53篇，获国家发明专利12项。医院还是北京市自然科学基金项目依托单位，申报北京市自然科学基金项目4项，立项1项。
现有128排和256层螺旋CT各1台，1.5T医用核磁1台，DR数字X光拍片机3台，还有飞利浦、GE、西门子高端彩超，配备腹腔镜、关节镜、电子胃镜及肠镜、全自动生化免疫流水线、全自动血液分析流水线、碎石机、血液透析机等大型进口医疗设备。