医院始建于1958年至今已有近60年的历史，原名建瓯芝城公社医院，后更名为建瓯城关公社医院、建瓯城关公社与建瓯芝城镇合并后为建瓯芝城医院。2008年4月8日建瓯芝城医院从新成立，建瓯市是个拥有60多万人口的城市--医院是一家经市政府批准改制的股份制医院。
建院伊始，原福建省人大主任袁启彤为医院题词“服务百姓，造福四方"，省领导的殷切期望一直成为我院的服务宗旨和办院理念，成为医院的座右铭。多年来，我们是这么说的，也是这么做的。医院座落在城关，美丽的黄华山脚下，交通便捷。医院目前有面积2000多平方米的六层的自建大楼，配有电梯（医梯），设有门诊部、医技部、住院部，拥有高级职称10余人，中级职称10余人，护士20余人，还有上级医院诸位专家经常来院帮扶会诊、手术、诊疗等活动。实际开放床位60张。拥有近2000万元的各种先进设备，包括乳腺钼靶机、彩超、高频X光机，“C"型臂X光机、监护系统、全自动生化分析仪、全自动血液分析仪、全自动电解质分析仪、尿十项分析仪、凝血四项分析仪、美国进口GE彩色B超、碎石机、腹腔镜、动态心电图、ZD型体外电场热疗机、GX-ⅢE型多功能电离子手术治疗机、JLT型综合治疗机（红光治疗仪）、德国狼牌第三代椎间盘镜系统…….属“小综合，大专科"的综合性医院。医技，职能科室一应俱全。其中康复科、普外科、骨科、妇产科为医院的“大专科"，品牌学科。建瓯人杰地灵，有良好的医疗环境，市委书记一再强调要力争在建瓯办好“建瓯人自己的医院，让百姓放心的医院"。芝城医院实力雄厚，医院用真诚凝聚人，用精彩的事业造就人，用良好的环境吸引人，用创新的体制培养人，筑巢引凤，招贤纳士，携手燕达，共创辉煌。
建瓯芝城医院设有泌尿外科、内科、普外科、妇科、骨科、风湿疼痛科、乳腺外科、结石科、痔疮科。
我们将以环境优美、设施齐全、卫生整洁、服务****、治疗规范、优质优价，便民快捷，实行人性化关怀治疗，提供以病人为中心的诚信服务。
