《北京中医药》,原刊名为《北京中医》,1951年5月,北京中医学会出版委员会成立,董德懋任主任委员,创办《北京中医》。同年5月,《北京中医》***卷创刊号出版(双月刊)。1952年改为月刊。
1955年1月,为了响应政府重视祖国医药文化遗产的伟大号召,贯彻第三届全国卫生行政会议关于“改进和提高中医药刊物”的决议,同时应广大的读者的要求,《北京中医》扩展全国性中医刊物,并更名为《中医杂志》,仍由北京中医学会主编,交由人民出版社出版。1956年成立中国中医研究院,《中医杂志》改为由其主办。
1980年初,经北京中医药学会(原中华全国中医学会北京分会)和北京中西医结合学会(原中国中西医结合研究会北京地区分会)常务理事会研究决定,申请创办《北京中医》杂志。1981年4月,经北京市委宣传部批准,《北京中医》再度创刊,由北京中医药学会与北京中西医结合学会联合主办。同年,《北京中医》**届编委会成立。1982年3月31日《北京中医》创刊号(季刊)正式出版、发行,1985年改为双月刊,2006年改为月刊。2006年10月,第三届常务编委会建议将《北京中医》的中文刊名变更为《北京中医药》,以促进中医药事业的整体发展。经北京市中医管理局同意,国家新闻出版总署批准,《北京中医》杂志于2008年1月正式更名为《北京中医药》。