学院始建于1958年9月，校名为泰县农业中等技术学校；1959年1月更名为泰州市农业专科学校；1961年9月更名为江苏省泰州畜牧兽医学校；1995年4月更名为江苏省畜牧兽医学校；2001年6月独立升格为江苏畜牧兽医职业技术学院；2013年3月更名为江苏农牧科技职业学院。