吉林市船营二医院始建于1956年，前身为吉林市中西医联合诊所，原址位于吉林省毓文中学东侧，1958年9月，更名为吉林市船营二医院。于1980年12月搬迁至吉林市船营区青岛街151号。
风雨兼程几十载，吉林市船营二医院现已发展成为一所集医疗、教学、预防、保健、康复、社区服务于一体的非营利性二级乙等综合性医院。隶属于吉林市船营区卫计局。是吉林市城镇职工、城镇居民、新农合、低保二次报销等医疗保险定点医院，是船营区****的慢性病定点医院和****一家健康扶贫“先诊疗，后付费”定点医院。
我院先后完成了与吉林大学第一医院集团式签约；吉林市中心医院、北华大学附属医院、吉林省吉林中西医结合医院医疗联合体签约；吉林市肿瘤医院、吉林省精神病院、吉林大学呼吸专科、吉林市中心医院泌尿专科的专科联盟服务签约，建立合作帮扶关系，与三甲医院7个科室结成队子。
医院占地面积2700多平方米，建筑面积4200多平方米，编制床位101张，现有职工224人（在编职工115人，外聘职工109人）高级职称30人（正高级职称1人，副高级职称29人），中级职称37人。
科室设置齐全，现有15个临床、医技科室，分别是：内科、外科、妇科、儿科、眼科、耳鼻咽喉科、口腔科、中医外科、中医内科、针灸理疗科、医学检验科、医学影像科、预防保健科，并设有内科、外科、康复科三大疗区，于2016年建立中医馆。
目前，医院拥有较先进的诊疗设备，包括美国GE16排螺旋CT、美国GEVIVIDS6彩色多普勒超声仪、南京普爱PLX8500E型DR、美国史塞克1188HD型腹腔镜、美国强生G11型超声刀、深圳迈瑞BS-800全自动生化仪、深圳开立SSI-5500型彩色多普勒超声仪、深圳迈瑞EX20麻醉机、无影灯等。
医院下辖3家社区卫生服务中心，即青岛街道社区卫生服务中心、致和街道社区卫生服务中心、向阳街道社区卫生服务中心。社区中心承担青岛、致和、大东、南京、向阳5个街道、19个社区、144180人的公共卫生服务功能。
每个社区中心设有多个家庭医生团队，负责辖区居民健康档案管理、健康教育、预防接种、孕产妇健康管理、0-6岁儿童健康管理、老年人健康管理、高血压和2型糖尿病健康管理、积极推进重性精神病人规范管理、传染病及突发公共卫生事件报告和处置、卫生监督等14项具体基本公共卫生服务工作。