中国中医科学院西苑医院济宁医院（济宁市中医院）始建于1959年，是国家三级甲等中医医院，省级区域中医医疗中心建设单位，拥有总院区、康复分院两个院区，是济宁市集中医、中西医结合医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体的大型综合性医院。总院、分院融合发展，倾力打造区域龙头中医医院。
目前医院是全国针灸临床中心济宁分中心、省级“文明单位”、济宁市“十佳群众满意医院”、济宁市工伤保险定点医疗单位、济宁市驾驶人查体定点单位。国家中医住院医师规范化培训基地；山东中医药大学附属医院；济宁医学院、山东中医药高等专科学校等五所院校的教学医院。
医院核定编制床位436张，设有43个临床医技科室。医院坚持突出中医特色，走专科发展之路。针灸科为国家中医药重点专科，针灸学为山东省中医药临床重点学科；心血管病科、肾病科、脑病科、推拿科、康复科、脾胃病科、内分泌病科、治未病科、中医护理为山东省中医药临床重点专科；急诊科、肿瘤科、骨伤科、重症医学科等科室为济宁市中医药重点专科。急诊科、重症医学科、外科等开设24小时急诊绿色通道，保障了急危重症患者的救治。
医院设有7个“国医大师传承工作室”，特邀石学敏、张大宁、吕景山、孙光荣、唐祖宣、张学文、李佃贵等国医泰斗为指导老师；2个省级名中医药专家传承工作室；23个市级名中医传承工作室，10个济宁市名医工作室，聘请来自中国中医科学院西苑医院、中国中医科学院广安门医院、北京中医医院、中日友好医院等国内知名医疗单位的专家、济宁辖区内省级名中医及市级名中医定期来院讲座、坐诊。
医院配置有15大类49种中西医诊疗设备，开展71项中医技术。有万元以上医疗设备260余台（件），包括处于国际前沿的1.5T核磁共振（MRI），CT两台，西门子ArtisZeeceilingDSA一台，非脊柱减压系统一套，全市最先进的肿瘤综合治疗系统一套，高清腹腔镜系统，超清鼻咽喉镜，超清电子胃肠镜，西门子数字胃肠机，全自动生化分析仪两台，彩超5台，多功能透析机（人工肾），电磁波碎石机，道生中医体质辨识系统，中医康复治疗系统等先进诊疗设备。
医院充分发挥中医优势，大力使用针灸、推拿、拔罐、艾灸等纯中医治疗，纯中医治疗报销比例高达90％，有效缓解百姓看病难题。
医院遵循“人本服务、厚德载医、弘扬国粹、务实创新”的服务宗旨，发挥中医药特色优势，强化医院内涵建设，不断完善惠民服务措施，深受广大群众好评，得到省、国家中医药管理局领导高度肯定。
2020年2月，西苑医院济宁医院（济宁市中医院）新院区建设项目启动，2020年11月项目开工建设，2022年10月项目封顶，计划2023年底投入运营。
项目位于济宁市太白湖新区（火炬路东、洸府河路西、渔皇路南、东赵路北）。项目规划总用地约203亩，建设总用地约168亩。设置床位1300张，停车位2253个，配置国内一流医疗设备及信息化系统。
主要建设内容：门诊医技楼、病房楼、传染楼、制剂楼、国医堂、科研教学楼和行政办公楼、制氧站、垃圾处理站、污水处理站、警卫室、城市公厕等。
项目设计采用新中式风格，突出“儒家文化”、“运河文化”等济宁地方文化特色和中医元素。项目建成后将成为集公共卫生中医医疗、综合医疗、教学、科研、中医药预防康复保健为一体的公共卫生健康服务综合体，全面提升全市中医药服务能力。
2022年9月14日，济宁市人民政府与中国中医科学院西苑医院签订合作协议，依托济宁市中医院合作共建国家区域医疗中心（西苑医院济宁医院）。经过不懈努力，西苑医院济宁医院以全省第一的成绩通过国家专家组实地核查，成功入选第五批国家区域医疗中心建设项目。
下一步，两所医院将深度合作，西苑医院长期派驻专家团队常驻西苑医院济宁医院，涵盖管理、医疗、设备、信息等专业，重点打造心血管病科、脑病科、脾胃病科、老年病科、肾病科、肺病科等6大专科，以及创伤中心、卒中中心、胸痛中心等3大中心建设。双方全力打造“立足鲁西南、辐射鲁苏豫皖”的全国一流国家区域医疗中心和国际中医药文化交流中心，让区域内居民家门口即可享受国家高质量中医药服务。