九江市妇幼保健院始建于1896年，其前身为美国基督教卫理公会创建的“但福德”医院，1901年创办了但福德附属护士学校，是赣北地区护士学校的发源地。现已发展成为长江中下游赣、鄂、皖毗邻地区一所集妇幼保健、医疗、康复、科研、教学为一体的三级甲等妇幼保健院。2012年增冠“九江市儿童医院”、2017年12月与市计生站合并增挂九江市妇幼健康计划生育服务中心。医院成为全省首批通过三级甲等妇幼保健院复审的医院，成为全省唯一一家新冠肺炎定点救治的妇幼保健机构，全省首批互联网医院。
医院拥有职工1400余人，开放床位1100张，年门诊量90余万，出院患者5万人次。现有甘棠院区、八里湖院区、宿松院区三个院区。承担14个县区200余乡镇妇幼健康业务管理和技术指导，担负着赣、鄂、皖三省毗邻地区近600万人口的妇幼健康服务任务，经市卫健委批准牵头组建九江区域妇幼医疗保健联盟，搭建了四级卫生健康服务网络，建立了17个网络平台。拥有国家孕产期保健特色专科建设单位、国家级住院医师规范化培训基地、全国妇幼保健中医药适宜技术（专病）培训基地等3个国家级基地。医院荣获全国文明单位、全国敬老文号、全国模范职工之家、国家级爱婴医院、国家级母婴安全优质服务单位、国家改善医疗服务示范医院、国家分娩镇痛试点医院等荣誉称号，医院综合实力进入全国“妇产医院50强”。医院主院区为甘棠院区，2013年动工建设八里湖院区并于2018年5月正式投入使用。2021年1月12日与安徽省宿松县妇幼保健院建立省际跨区域紧密型医联体，建立了宿松院区。