西湖区疾病预防控制中心由建站40多年的西湖区卫生防疫站分离组成，于2006年1月正式成立，办公楼位于洪城路与抚生路交汇处（西湖区政府对面），房屋面积3152.04平方米。
中心设有综合防治管理科、免疫规划科、传染病防制科、性病·艾滋病防制科、结核病防制科、消毒与生物媒介防制科、学校卫生健康教育科、检验科、体检监测科、办公室、财务科、总务科等12个科室,现有在编职工64人，中心有高级职称7人，中级职称16人，初级职称24人。
中心主要承担辖区内50多万人口的疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处理、疫情收集与报告、儿童规划免疫、病媒生物防治、卫生监测和评价、健康教育和促进等任务。中心拥有原子吸收分光光度计、原子荧光光度计、液相色谱仪、气相色谱仪等仪器设备，具有先进的卫生检测能力、综合防病能力和科学管理水平。
