复旦大学上海医学院司法鉴定中心（原上海医科大学法医学鉴定中心）于1992年成立。2002年7月29日经上海市司法局审核确认，设立“复旦大学上海医学院法医学鉴定中心”（司法鉴定许可证证号：310099017）。本鉴定中心隶属于复旦大学。2010年12月本鉴定中心更名为：复旦大学上海医学院司法鉴定中心。本鉴定中心分别在2010年3月、4月通过了国家CNAS认可及资质认定，并持续保持至今。
本鉴定中心作为高等医学院校的司法鉴定机构，充分发挥高校优势，依托实力雄厚的基础医学和临床医学，有完好的学术梯队，良好的教学基地，充足的教学、科研和鉴定资源，满足司法行政机关规定的人员、资金、场地、仪器设备的要求。
鉴定中心成立以来，坚持实事求是、科学鉴定的原则，做到严谨求实、独立公正、科学规范、准确客观，为司法实践活动提供了科学依据，鉴定结果采信率达到99％以上，取得了良好的社会效益。本鉴定中心面向社会，接受全国公、检、法、司等机关以及企**、社会团体和个人的委托，对诉讼、仲裁等活动中所涉及的专门性问题进行检验/检测。本鉴定中心的业务范围：法医病理鉴定、法医临床鉴定、法医物证鉴定、法医毒物鉴定、痕迹鉴定和法医精神病鉴定。法医病理鉴定主要是尸体检验，结合实验室检查，进行死亡原因鉴定、死亡方式及致伤物推断等；法医临床鉴定主要是从事人体损伤程度鉴定和人体伤残**鉴定等；法医物证鉴定主要是亲子鉴定和个人识别等；法医毒物鉴定主要是血液、尿中乙醇及常规毒物、毒品的检测；痕迹鉴定主要是对交通事故车辆相撞的后果及成因系列的鉴定；法医精神病鉴定主要是精神障碍损伤程度、伤残**鉴定及行为能力、刑事责任能力鉴定等。
目前鉴定中心有注册司法鉴定人54名，其中职称鉴定人30名，占55％；博士21名，硕士9名。
