清华大学医学院成立于2001年10月25日，**医学科学家、两院院士吴阶平先生担任首任院长，生物物理学家赵南明教授、结构生物学家施一公院士、神经科学家鲁白教授、免疫学家董晨教授先后担任常务副院长。2016年9月，董晨教授担任医学院院长。
医学院目前下设两个系一个中心：基础医学系、生物医学工程系、公共健康研究中心，涵盖了细胞与分子生物学、免疫学、传染病学与微生物学、生物医学工程、神经科学和公共健康学六大学科。经过15年的发展，医学院的队伍不断壮大。目前，全院共有教职工331人，在站博士后86人，学生1205人。在人事制度改革的推动下，我院吸收杰出海外归国人员，加快以教研系列人员为主体的师资队伍建设。目前，全院事业编教职工共94人，其中教研系列56人，教学系列8人，研究系列19人，实验技术人员10人，教育职员1人。
学院教师队伍中，诺贝尔奖获得者1人，院士3人，千人计划教授11人，青年千人计划引进8人，万人计划-领军人才1人，万人计划-青年拔尖人才1人，长江学者特聘教授6人，青年长江学者2人，国家杰出青年基金获得者6人，国家青年科学基金6人。
在师资队伍的带领下，医学院明确人才培养目标，完善培养方案，致力于培养既掌握临床技能又具备科研能力，能在医学领域从事研究、医疗服务、教学及管理的医学科学家、高级临床医生、医学教育工作者和医学高级管理人才。在全院师生的共同努力下，医学院的科研水平步步升高，所取得的科研成就硕果累累。2015年，我院多个年轻的研究团队在Nature
和Science等国际期刊及其子刊发表12篇文章，逐步摆脱跟踪追随的科学模式，建立了****新方向的国际影响力。
