2017年12月开始，医院以福建省妇幼保健院为中心，筹建省儿童医院和省妇产医院，融合省计划生育研究所，创建高水平研究型福建省妇儿总医院，并建设省妇儿医学研究院、福建医科大学妇儿临床医学院。福建省儿童医院（国家儿童医学中心上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心福建中心）项目总投资33亿，占地233亩，开放床位1000张。医院定位为区域内儿科疑难危重症的诊断与治疗中心，协同国家儿童医学中心，以救治儿童常见病、多发病、罕见病和疑难重症为重点，在区域内实现医疗、科研、教学、预防和管理五大功能，促进区域间儿科医疗服务同质化。医院将于2020年底开业。福建省妇产医院是批由省卫健委行政主管部门作为业主直接组织试点的项目，是作为全省卫生健康2018年八大重点工作重要内容之一。医院项目总投资23亿，占地154亩，开放床位800张，将建成为集医疗、教学、科研和预防为一体的妇女疾病诊疗中心、围产医学中心、母婴医疗保健专业机构及急危重妇产救治中心，预计2021年底开业。
