乌海樱花医院现有临床科室16个：急诊医学科、综合内科（含神经内科、血液病科专业、心内科、呼吸内科专业和ICU重症监护、消化内科、内分泌科专业、肿瘤科、放疗科）、中医康复科、普外科、骨外科、妇科、眼科、疼痛科、皮肤科、耳鼻喉科、老年病科、体检科、蒙医心身医学科等。医技及辅助科室医院现在医技科室及辅助科室11个：超声科、放射科、手术室麻醉科、检验科（血库）、消化内镜室、理疗科、功能科（可做肺功能和心电图等心脏功能检查）、药剂科、消毒供应室、病案室。
医院编制床位200张，开放床位196张。医院拥有沈阳东软医用直线加速器，珠海和佳免疫治疗系统、体外高频治疗仪、体腔热灌注机，东芝螺旋CT，北京万东1.5T超导磁共振，美国菲利浦Q7高端彩色超声仪，美国迪姆动态血压检测仪，美国迪姆心电工作站，意大利科时迈弥散残气肺功能仪，重庆远舟数字式医用红外热像仪，深圳理邦ICU无线****监护系统、德国elisa有创呼吸机、德国费森尤斯急性透析和体外血液治疗机，美国GE公司的DR机，日本富士彩色电子胃镜、肠镜、十二肠镜、胆道镜，奥林巴斯腹腔镜，东芝全自动生化分析仪，德国莱卡全自动染色封片机、切片机、病理工作站等。
