位于南通市跃龙南路36号，为三级口腔专科医院，建筑面积1.6万平方米，椅位150张，床位50张。医院成立于1988年，南通地区唯一一所公立口腔专科医院，临床科室设置齐全，拥有口腔专业一级学科八个，口腔内科、口腔颌面外科、口腔修复科、口腔种植科、口腔正畸科、口腔预防保健科、急诊综合科、麻醉科；二级学科四个，牙体牙髓病科、牙周病科、粘膜病科、儿童牙病科；医技科室五个。其中牙体牙髓黏膜病科、牙周病科、正畸科、儿童口腔科、口腔修复科是南通市临床重点专科，种植科是南通市临床特色专科。医院集医疗、预防、教学、科研为一体，承担着南通市及周边地区广大居民口腔疾病临床诊疗和预防保健任务。另开设永兴分院（黄海路98号）、观音山门诊部（中桥名邸14幢）。
医院医疗设备先进，拥有德国锥形束口腔CT、曲面断层全景X光机、数字化放射影像系统（DR）、X线头影测量系统、蔡氏口腔显微镜、德国史塞克正颌外科动力系统、瑞士种植机等国际先进医疗设备。
医院专家团队实力雄厚，现有职工400名（其中高级职称47，中级职称114），硕博士61名。医院现有国家级理事1人、国家级口腔专业委员8名；省口腔医学会副会长1名，省级专委会副主任委员7名，省级常委、委员、青委35名；市级主任委员3名、副主任委员3名、委员24名。承担南京医科大学和南通大学口腔医学专业本科的临床教学，以及南通大学部分本科专业口腔医学理论授课。有南通大学兼职教授5名、讲师6名。
医院现为南通大学附属南通口腔医院、上海九院十大口腔专科联盟成员单位、国家口腔疾病临床医学研究中心核心单位；江苏省口腔医学会副会长单位、南通市医学会口腔医学分会主任委员单位，南通市口腔科医疗质量控制中心；南京医科大学教学医院、兰州大学教学医院、苏州卫生职业技术学院教学医院，国家住院医师规范化培训基地协同医院；韩国登腾种植牙南通技术交流中心、中日友好医院“口腔医学与口腔美容专科医联体”、南通市口腔卫生干预项目指定医院。