医院始建于1932年，前身是建德市第三人民医院，2013年更名为“建德市中西医结合医院”。同年10月，在全省“双下沉两提升”的民生工程及上级主管部门的大力支持下，与杭州市中医院建立紧密型合作关系，成为“杭州市中医院建德分院”。
2017年5月，医院整体搬迁，新医院占地面积42.7亩，核定床位250张，开放床位250张，现有职工377人（正式编制225人），其中高级职称55人，中级职称114人，享受国务院政府特殊津贴1人，杭州市D类人才3人，杭州市E类人才10人，建德“282”人才7人，浙江省基层名中医1人，杭州市名中医1人，杭州市基层名中医1人，建德市名中医2人，硕士研究生11人。
开设了科目齐全的门诊和医技科室，设健康体检、中医“治未病”中心、中医馆等，开放呼吸内科、消化内科、心血管内科、中医内分泌科、肾内科、外科、骨科、针推康复科、肿瘤科、妇科、ICU等病区及血透中心。拥有国际上先进的1.5T鑫高益磁共振、西门子62排124层螺旋CT、奥林巴斯CV-290电子胃肠镜、双定位体外碎石机、钬激光碎石系统、智能上下肢康复训练机、史塞克关节镜、史塞克高清腹腔镜等先进诊断和治疗设备。