2017年3月，中国石油集团在国家深化国企改革背景下，利用社会资本成立宝石花医疗集团，注册资本100亿。截至2019年3月，宝石花医疗集团已经完成了16家中石油各地区公司所属职工医院的社会化改革，拥有34家全资及控股子公司，集团所属医疗机构共计166家，初步成为国内规模的医疗集团。新疆宝石花医疗健康管理有限公司成立于2019年1月，按照中国石油天然气集团公司的批复，宝石花医疗集团与中国石油乌鲁木齐石油化工有限公司、新疆油田公司、吐哈油田公司合资设立的新疆宝石花医疗健康管理有限公司正式挂牌成立。作为医院的举办人，管理原中国石油乌鲁木齐石油化工总厂职工医院，现更名为新疆宝石花医院；吐哈油田哈密鄯善职工医院，现更名为哈密市宝石花吐哈医院；准东职工医院，现更名为昌吉州宝石花医院三家国家二级甲等综合医院。各家医院均是在本区域专业能力较强，集医疗、预防保健、职业病防治、教学及企业应急救援保障为一体，为企业职工家属及周边居民提供健康服务的，资源丰富，资金雄厚具有实力的医院。
