上海市第六人民医院始创于1904年，其前身为上海西人隔离医院，是一家历经百余年积淀的大型三级甲等综合医院。2002年成为上海交通大学附属医院，2021年2月原上海市第六人民医院东院整建制正式并入上海市第六人民医院，开启了两院一体化高质量发展的新征程。目前，医院设有徐汇、临港两个院区；核定床位2366张（批复床位3226张），其中徐汇院区1766（批复床位2026张）张、临港院区600（批复床位1200张）张；临床医技科室52个。近五年来，医院年门急诊量最高突破500万人次，年出院人次最高达到近15万人次，年住院手术最高超过11万人次。
医院深入贯彻《关于加强公立医院党的建设工作的意见》精神，切实加强党对公立医院的领导，始终坚持公立医院实行党委领导下的院长负责制。连续六届17年蝉联“全国文明单位”荣誉称号，连续15年上海市级医院绩效考核全A。在复旦大学医院管理研究所发布的最佳医院排行榜中，医院综合排名最高25名。在中国医学科学院发布的中国医院科技影响力排行榜中，医院综合排名最高26名。在2019年度国家三级公立医院绩效考核中，医院排名37名。在2021年自然指数年度学术机构榜单中，医院首次进入医疗机构NATURE指数全球前100名，排名第90名。医院积极贯彻落实国家深化医疗体制改革政策，践行医疗联合体探索与实践，2000年开启上海市第六人民医院医疗集团宏伟征程，实现了集团医院机构能级、医疗服务、学科建设、社会认可“四提升”。医院积极响应国家区域医疗中心建设号召，旨在深入实施健康中国战略，推进医疗健康领域供给侧结构性改革，着力解决群众看病难问题，分别与福建省人民政府、安徽省人民政府合作共建“大专科、小综合”的上海市第六人民医院福建、安徽医院，建设国家创伤区域医疗中心。