北京清华长庚医院是融医疗、教学、科研、预防、康复于一体的大学附属医院，医疗科室设置齐全，包括内科系统、外科系统、妇科、儿科、眼科、口腔科、检验、病理、影像等40余个临床和医技科室。开业初期，医院将优先发展具有国际前沿水准的肝胆中心、神经中心、消化中心，重点发展心脏内科、妇产科、耳鼻咽喉头颈外科、泌尿外科等专科，藉此带动医院整体医疗水平的快速提升。北京清华长庚医院坚持以病患为中心，引进和借鉴台湾长庚纪念医院的管理模式，实行理事会领导下的院长负责制，建立医管分工合治的现代医院管理体制，通过专业化医疗与职业化管理的有机结合，大力提升医疗服务品质与运营管理效率。北京清华长庚医院拥有一支海内外专家组成的高水平的医师与护理团队，坚持病患利益大化的精益医疗理念，实行Attending医师负责制和全责护理模式。推行以疾病为中心的整合式医疗，合理安排就医动线，持续优化医疗流程，为各类病患提供、温馨的诊疗服务，不断提升疾病率和康复水准。医院配备先进的医疗设备，为高品质的医疗服务提供了有力保障。除了3.0T磁共振检查仪、低剂量128层宝石CT、3D彩超、遥控胶囊内镜、双平板DSA、高能直线加速器等检查治疗设备以外，还配有国内首台双荧光神经外科手术显微镜、心电一体化监护仪、手术导航系统、O型臂X光机、3D腹腔镜手术系统、术中腔镜彩超等设备。作为诞生于医改大背景下的新型医院，北京清华长庚医院秉持“人本、济世、厚德、至善”的价值，以“提供健康守护、培养医学精英、创新临床研究、追求卓越管理”为使命，充分依托清华大学厚重的人文底蕴和宽实的科技平台，创建新时期公立医院改革与发展的新模式，努力建设成为国际的医学中心。
