医院与北大六院陆林教授团队、上海市精神卫生中心方贻儒教授团队、墨尔本大学Ian Everall教授团队、美国哈佛大学医学院附属波士顿儿童医院儿少精神科Myron Lowell Belfer教授团队、伦敦国王学院Robin Mac Gregor Murray院士团队和上海交通大学医学院附属精神卫生中心李华芳教授精神康复与物理治疗团队等深入合作,不断提升医、教、研、防水平。分别与北京大学第六医院、中南大学湘雅二医院共建“国家精神心理疾病临床医学研究中心北京大学第六医院深圳分中心”和“国家精神心理疾病临床医学研究中心中南大学湘雅二院深圳分中心”,与四川省精神卫生中心合作建设“《四川精神卫生》杂志深圳工作站”,与美国纽约大学社工学院联合举办精神卫生医务社工培训,与加拿大多伦多大学联合开展主动式社区治疗ACT项目,与美国罗彻斯特大学联合开展自杀预防与干预相关研究。