昆山市中医医院于1985年1月独立建院，2019年获批成立江苏省中医临床研究院昆山分院，是一家集医疗、教学、科研、康复、预防、保健为一体的现代化三级甲等中医医院。2022年11月26日，医院顺利搬迁至新址西部医疗中心，新院区占地约200亩，建筑面积31.5万平方米，床位2,000张。新院整体建筑借鉴江南园林设计理念，为患者提供「智能、方便、快捷、温馨」的医疗服务。
2023年医院年门急诊总量186.8万人次，出院5.3万人次，手术量突破3万例。医院现有在岗职工1,959人，其中高级职称568名，硕、博士研究生415名，其中博士41名，硕、博士生导师22名。拥有全国首批五百名老中医药专家郑绍先学术经验继承人3名、江苏省名中医2名、江苏省中医药领军人才1名、国家中医药管理局中医药外向型优秀骨干人才1名、江苏省「333工程」第三层次培养对象5名、江苏省「六大高峰人才」1名、江苏省「双创博士」1名、江苏省优秀中青年中医临床人才1名。
医院科室设置齐全，技术力量雄厚，已开展多项区域内首例新技术。设有一级临床科室36个，医技科室14个。拥有国家临床重点专科（中医专业）1个，国家中医药管理局临床重点专科1个，江苏省中医药重点学科1个，江苏省中医重点专科7个，苏州市临床重点专科2个，苏州市重点学科1个，苏州市中医重点专科12个。郑氏妇科疗法、闵氏伤科疗法为江苏省非物质文化遗产。医院启用制剂生产与研发中心，建筑面积1.2万平方米，拥有取得批准文号的医院制剂102种，其中中药制剂88个品种。
医院贯彻科教强院理念，着力营造浓厚科创氛围。2021年，启用中心实验室，成功备案国家药物临床试验机构，中医消化、中医骨伤科、中医呼吸、中医肿瘤4个专业获批GCP资质；2022年，完成医疗器械临床试验机构备案评估验收；2023年，新获批苏州市中西医结合消化病重点实验室1个，昆山市学科重点实验室1个。截至目前，医院拥有国家自然科学基金青年项目6项、江苏省自然科学基金3项，江苏省重点研发计划1项。
39年来，医院始终坚持「精诚仁和」的院训，秉承「团结进取、勤奋务实、争创****」的医院精神，履行「中医献温馨，健康进万家」的服务宗旨，先后荣获全国示范中医院、国家中医药管理局中医药国际合作基地、全国青年文明号、全国卫生系统创先争优活动先进集体、全国医院文化建设先进单位等荣誉称号，六次蝉联全国文明单位。传承精华，守正创新，医院将继续坚持以人民健康为中心，精准对接人民群众日益增长的多样化健康需求，为建设中医药特色浓厚、中西医融合创新、新兴前沿技术蓬勃发展的现代化高水平中医医院而不懈努力。
