医院始建于1951年10月，前身由原中国天主教万县区私立世光医院经政府接管后改建而成，原名为四川省万县市人民医院，因行政体制调整，历经四川省万县市第三人民医院、重庆市万州区第三人民医院、重庆市万州区人民医院。2020年7月医院成建制上划市级管理，为市卫生健康委所属事业单位，增加履行重庆三峡医药高等专科学校附属医院职能，医院更名为重庆三峡医药高等专科学校附属人民医院。2021年7月，为优化区域医疗资源布局，在重庆三峡医专指导下，开启了与重庆三峡医药高等专科学校附属医院整合。2023年2月，经重庆市编委研究，同意重庆三峡医药高等专科学校附属医院整体并入重庆三峡医药高等专科学校附属人民医院。
医院是一所由重庆市卫生健康委直管、重庆三峡医药高等专科学校直属，集医疗、教学、科研、预防保健和康复为一体的三级综合教学医院。拥有重庆市全科医师规范化培训基地，重庆博士后科研工作站。目前设有两个院区，国本路院区（原万州区人民医院）位于万州区国本路27号；高笋塘院区（原三峡医专附属医院）位于万州区关门石38号，总占地面积约53亩，建筑面积10.7万平方米，编制床位1220张，开放床位1380张，未来占地206亩的高峰新院区将在2023年动工，实现一院三区的发展格局。
医院学科设置齐全，设有58个临床和医技科室，12个临床教研室及实验室，建有国家药物临床试验机构、万州区皮肤病临床研究所和万州区针灸技术应用研究所。国本路院区以微创和介入为主要的医疗技术特色；高笋塘院区以中医康复、针灸和皮肤科为主要的优势学科。心血管内科为国家标准化心脏康复中心、重庆市临床重点专科；眼科为市级医学重点学科、临床重点专科；针灸科为国家级特色专科在建项目，重庆市中医重点学科；皮肤科为重庆市级特色专科、万州区重点学科；泌尿外科为重庆市临床重点专科；重症医学科为重庆市临床重点专科在建项目；肿瘤科为市级中医特色专科、区级医疗特色专科；呼吸与危重症医学科为万州区创新创业示范团队。
现有在岗职工1413人，其中专业技术人员1261人，高级职称210人，硕士研究生及以上学历56人。全国中医临床优秀人才2人，重庆市名中医3人，万州区学术技术带头人6名。
设置有洁净手术室、洁净监护室等，设施设备齐全。拥有配备联影天河超高端320层CT、高分辨率C型臂X光数字减影系统、直线加速器、西门子256层螺旋CT、西门子1.5T核磁共振、蔡司飞秒激光角膜屈光治疗机、32排移动车载CT等一大批先进医疗设备。
建有“三峡针灸应用技术研究所”“万州区皮肤病临床研究所”“重庆三峡库区微创外科临床研究中心”3个医学科研机构。针灸科是集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的特色专科门诊，设有针灸、中医骨伤，颈肩腰腿痛、膝骨关节等9个专科门诊，对针刺作用机理等方面进行广泛、深入、系统的研究，在重庆市针灸领域保持领先水平。皮肤科始建于1976年，经过40余年的发展，成为渝东片区规模最大、技术力量最强、设备最好的集临床、教学、科研为一体的皮肤性病防治专科，专科拥有设备完善的外用药制剂室，自制外用药物20余种，在渝东北片区患者中享有良好声誉。微创外科临床研究中心下设涵盖肝胆、介入、妇产、神外、泌尿等8个微创研究室，微创手术占比始终保持在31％以上。心血管内科为国家标准化心脏康复中心建设单位，冠状动脉和外周血管介入开展数量及水平逐年提升。
医院始终坚持以患者为中心服务理念，积极推进优质医疗服务，加强信息化建设，打造智慧医院；建设医疗自助系统，优化就医流程。医院率先在万州区推出互联网医院，患者免费在线咨询、复诊，药品快递到家，推出了“互联网+护理延伸服务”，大大方便了患者就医，改善了患者的就医体验。
医院先后被授予“全国公共机构节能示范单位”、“重庆市级文明单位”“重庆市优秀卫生单位”“万州区委先进基层党组织”“民众喜爱医院”“万州区五星级文明示范窗口”等荣誉称号。