高邮市中医医院建院40余年，经过沧桑风雨洗礼和几代人的艰苦创业、锐意进取，取得了显著的成就，中医药和综合服务能力不断提升。是一所集中医医疗、预防、急救、康复、教学、科研为一体的综合性三级乙等中医医院，是全国首批农村中医药工作先进市(县)龙头单位，是南京中医药大学、安徽中医药大学、扬州环境资源职业技术学院等多家高等院校教学医院、江苏卫生健康职业学院驻点教学医院，系江苏省首批中医“治未病”健康工程试点单位，中国工程院院士、国医大师王琦传承工作室共建单位。与江苏省中医院、中大医院、省肿瘤医院、扬州市中医院等多家三甲医院建立紧密合作关系，成立了施瑞华、张治、张晓春等教授工作室，并常年邀请上级专家来院业务指导和教学。在扬州市县级医院中率先建成互联网医院。
医院现拥有两个院区，改扩建成高邮市中医老年护理院，全院总建筑面积约6万多平方米，编制床位800张。建有符合GMP标准的制剂室，可生产13个剂型、30余种中药制剂。建成规范的发热门诊和PCR实验室。现有在职职工756人。有介入科、骨科2名博士，硕士研究生48人，高级职称128人，设有40个临床医技科室，16个病区，1个血液透析中心。
拥有数字减影血管造影仪（DSA）、美国GE1.5T核磁共振、64排128层CT3台、方舱CT1台、瓦里安医用直线加速器、钬激光、关节镜等一大批现代诊疗设备及中医体质辨识仪、威伐光、中药熏蒸仪等一系列中医诊疗设备。建有符合GMP标准的制剂室，可生产13个剂型、30余种中药制剂。建成规范的发热门诊和PCR实验室。
医院始终坚持发挥中医药特色，始终坚持“融汇中西，强化特色，惠泽百姓”的办院宗旨，高度重视“名医、名科、名院”三名战略的实施。以专科建设为抓手，支持各科积极开展新技术、新项目，有综合介入、妇科内镜、呼吸内镜、消化内镜等13项诊疗技术获得限制类技术审批备案。有专病门诊22个，针灸推拿科为国家中医药局农村中医特色专科建设单位，肿瘤科为江苏省中医临床重点专科，有8个扬州市中医临床重点专科：骨伤科、儿科、肿瘤科、肾病科、心病科、脑病科、脾胃病科、针灸康复科。
2019年，牵头成立了高邮市中医医疗集团，与卸甲、八桥、汤庄、汉留、武安、车逻、城南等7家基层医疗机构建立紧密型医共体协作。2020年成立了理事会并通过了《医共体章程》，成立中医专科联盟。医院始终重视科研教学工作，打造学习型医院。与中国中医科学院、浙江大学医学院附属邵逸夫医院共同合作了大数据驱动的中医智能辅助诊断服务系统项目。在扬州名中医“师带徒”项目中，共有6名扬州名中医和11名中医师达成了师承结对关系。
医院高度重视改善医疗服务行为，在本地区率先实行“一号制”、率先开通移动自助支付；切实实行“三合理”，减轻病人负担；成立医务社工部，有专业的志愿者团队，为患者提供全流程健康服务；上线互联网医院，推出互联网＋护理服务，推出扬州市**家数字云影像技术，利用互联网技术更好地为广大群众服务。先后被授予“江苏省规范收费医院”、江苏省平安医院、扬州市卫生系统“三好一满意”、高邮市文明单位等荣誉称号。
未来，医院将围绕“解放思想、顺应医改、聚力创新、改善服务”十六字发展方针，深入实施“一二三四工程”，继续努力，久久为功，守正创新，笃实前行，精心擘画“十四五”，把中医院打造成患者满意、员工满意、政府满意的“三满意”的本地**的人文医院，实现现代化中医医院建设的宏伟目标。
