上海长征医院南京分院建于1950年。现隶属于第二军医大学长征医院，是一所集医疗、教学和科研为一体的，具有社会公益、部队特色的综合性三甲医院。分院占地面积16064平方米。医院规模床位512张，实际展开床450张，职工500余人。
医院临床医技科室齐全，重点科室技术特色明显。设有临床科室15个，有7个诊疗中心。医院拥有专业技术人员349名；高级职称技术人员26名；中级职称技术人员99名；高学历人才19余名。
为进一步推进分院的学科和人才队伍建设，打造医疗服务特色，实行分院学科、专业与总院同质化管理。上海长征医院安排60多名专家教授每周轮流来分院坐诊。分院骨科、消化内科、肾内科（含血液透析）、普外科、泌尿外科、麻醉科等6个重点科室主任由上海长征总院派遣常驻，开展日常诊疗和病区管理，他们在各自的专业上都有较深的造诣和丰富的经验，使南京人民在家门口就能享受到上海名医、专家的优质服务。
医院秉承“强专科、精综合”的理念，在脊柱伤病，关节外科，断肢（指）再植，腔镜微创手术，急救创伤救治，消化内窥镜诊疗，肾病综合治疗（血透、腹透），泌尿系统碎石以及神经康复综合治疗（含高压氧）等方面具有一定特色。
为充实分院人才队伍，现面向社会招聘各类医学专业技术人才。
