孔医堂创建于2009年，它的前身是中医行业****的******孔伯华医馆。孔者，孔子之人文文化；医者，生命自然。孔伯华（1884-1955），孔子后裔，京城四大名医之一，也是我国近代一位具有民族气节和极高声誉的中医学家和中医教育家。
孔医堂基于“孔伯华医馆”，倡导“经典与时尚、传统与现代、中国与国际”相结合的理念，旨在弘扬中医传统文化，并丰富其内涵。搭建以北京名老中医、京城四大名医的传人和后人为主导的诊疗平台，传承原汁原味的中医诊疗。同时，引导人们从这里读懂中医，传承中医文化精神，开启中医文化窗口，将中医文化与养生文化融为一体，设有传统中医诊疗、健康管理、中医体检、国医讲堂等项目，为民众提供服务。
孔伯华中医世家医术2021年5月，入选“第五批******非物质文化遗产代表性项目名录”。
目前，孔医堂已经形成了在集团整体框架下发展现代高端医疗服务、教育培训、以及产品研发三大板块，在北京拥有医疗会馆三家。
2023年孔医堂落地南京秦淮区成立南京秦淮孔医堂中医诊部。孔医堂南京馆正式开业，设有多个中医科室，聚集南北明医，始终谨记“办诊务以求实效兴教育以继传承”的嘱托，以实际行动践行先生的“未竟之志”。
2024年5月孔医堂南京馆成为医保定点机构。
